39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0399 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  39.36 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  30.71 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.66 
 
 		 167 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  37.88 
 
 		 163 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  34.44 
 
 		 140 aa  52.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.15 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  27.15 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  28.45 
 
 		 185 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.52 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  30.37 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  27.5 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30.23 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  34.78 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  34.72 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  28.4 
 
 		 164 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  27.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  25.97 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  30.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  34.29 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  30.38 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  32.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  31.58 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.79 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  31.07 
 
 		 403 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0250  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  32.29 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.47 
 
 		 187 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  27.84 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.9 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  25.53 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  31.46 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  31.46 
 
 		 150 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>