More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1871 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  43.65 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  43.2 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  47.01 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  43.9 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  29.17 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  35.53 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 337 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  36.45 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  32.11 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  29.57 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 329 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  27.62 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  27.62 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  40.79 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 304 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35.34 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>