More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1244 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1244  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1165 aa  2292    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0173598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  45.42 
 
 		 1251 aa  670    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  39.74 
 
 		 1262 aa  529  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 1165 aa  463  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  32.49 
 
 		 1184 aa  238  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  24.2 
 
 		 1282 aa  181  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1057 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  26.12 
 
 		 1241 aa  164  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.52 
 
 		 1241 aa  161  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.19 
 
 		 1241 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.19 
 
 		 1241 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.36 
 
 		 1241 aa  160  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.68 
 
 		 1241 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.68 
 
 		 1241 aa  159  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  22.69 
 
 		 1003 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.57 
 
 		 1236 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  21.88 
 
 		 1207 aa  140  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 		 1080 aa  140  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 1240 aa  138  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.51 
 
 		 1203 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 1117 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  27.03 
 
 		 1242 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.49 
 
 		 1226 aa  134  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.84 
 
 		 1251 aa  131  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 1110 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 		 795 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  22.2 
 
 		 1248 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.82 
 
 		 768 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 1149 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 1196 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.62 
 
 		 794 aa  128  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.84 
 
 		 1156 aa  127  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 1061 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.69 
 
 		 1186 aa  126  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.5 
 
 		 1217 aa  127  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.08 
 
 		 713 aa  125  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.87 
 
 		 730 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 1123 aa  125  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 768 aa  124  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 		 736 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.5 
 
 		 1244 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.18 
 
 		 751 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.41 
 
 		 751 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 1065 aa  123  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.25 
 
 		 763 aa  123  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 707 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  26.01 
 
 		 1242 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 1121 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 		 1107 aa  122  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.51 
 
 		 725 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.38 
 
 		 1240 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.29 
 
 		 838 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.53 
 
 		 756 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.42 
 
 		 858 aa  120  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.39 
 
 		 715 aa  119  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.69 
 
 		 1224 aa  118  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  20.94 
 
 		 1124 aa  118  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.47 
 
 		 762 aa  118  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.01 
 
 		 754 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  28.15 
 
 		 657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  26.93 
 
 		 678 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 762 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 744 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  27.16 
 
 		 1183 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 786 aa  117  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.76 
 
 		 1212 aa  117  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 		 781 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 1083 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.33 
 
 		 817 aa  115  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 765 aa  115  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.76 
 
 		 1241 aa  115  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 678 aa  115  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.63 
 
 		 1240 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.12 
 
 		 830 aa  114  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 		 784 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.76 
 
 		 1226 aa  114  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.84 
 
 		 732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 678 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.59 
 
 		 1241 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 		 1047 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.35 
 
 		 742 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.93 
 
 		 785 aa  114  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.93 
 
 		 785 aa  114  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.6 
 
 		 772 aa  113  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 741 aa  113  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  24.62 
 
 		 1208 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.53 
 
 		 1200 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 743 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.84 
 
 		 1161 aa  112  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 1115 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.91 
 
 		 786 aa  111  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 678 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.95 
 
 		 837 aa  111  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.16 
 
 		 762 aa  111  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.45 
 
 		 730 aa  111  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.02 
 
 		 773 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.45 
 
 		 730 aa  111  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.48 
 
 		 725 aa  111  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.56 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 1131 aa  110  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>