245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0070 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.26151e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.01623e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.94925e-05  unclonable  9.43905e-09 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
198 aa  398  1e-110  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.75826e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  99.49 
 
 
198 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  96.97 
 
 
198 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  96.97 
 
 
198 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  96.97 
 
 
198 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  96.97 
 
 
198 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  96.46 
 
 
198 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  94.95 
 
 
198 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 
198 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  6.77674e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  84.26 
 
 
198 aa  327  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  83.84 
 
 
198 aa  326  2e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  83.33 
 
 
198 aa  325  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  83.76 
 
 
198 aa  325  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  83.33 
 
 
198 aa  325  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  83.33 
 
 
198 aa  325  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  83.33 
 
 
198 aa  320  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  66.84 
 
 
196 aa  272  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  66.84 
 
 
196 aa  272  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.10739e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  66.32 
 
 
210 aa  267  6e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  64.25 
 
 
196 aa  253  1e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.12742e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  2e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  1.30483e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  61.98 
 
 
197 aa  241  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  60.41 
 
 
197 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  60.42 
 
 
197 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.69162e-08  unclonable  2.94752e-08 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 
197 aa  231  4e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  60.94 
 
 
197 aa  230  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  60.41 
 
 
197 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  59.56 
 
 
195 aa  227  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  60.94 
 
 
197 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  5.49659e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  59.38 
 
 
197 aa  225  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.35011e-05  unclonable  6.36307e-11 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  53.61 
 
 
198 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  58.85 
 
 
197 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  9.84177e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  55.28 
 
 
200 aa  221  5e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  47.67 
 
 
219 aa  198  4e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  52.63 
 
 
197 aa  198  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.40669e-12 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  50.54 
 
 
199 aa  191  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  52.06 
 
 
205 aa  188  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  49.73 
 
 
195 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  50.84 
 
 
216 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  50.27 
 
 
217 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  50.55 
 
 
214 aa  164  6e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  46.23 
 
 
231 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  47.34 
 
 
220 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  47.34 
 
 
216 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  42.86 
 
 
240 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  45.21 
 
 
220 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  47.45 
 
 
227 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  44.5 
 
 
233 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  45.1 
 
 
232 aa  152  3e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  44.1 
 
 
229 aa  152  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  44.1 
 
 
229 aa  152  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  44.1 
 
 
229 aa  152  3e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  44.1 
 
 
229 aa  152  3e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  43.59 
 
 
229 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  43.59 
 
 
229 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2257  nucleoid occlusion protein  49.43 
 
 
192 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.178912  hitchhiker  2.16309e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  46.11 
 
 
200 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  44.56 
 
 
221 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  45.5 
 
 
216 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  46.07 
 
 
214 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0589  nucleoid occlusion protein  46.07 
 
 
214 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45381  normal  0.299357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  46.07 
 
 
224 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  1.91569e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  44.81 
 
 
202 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  42.35 
 
 
230 aa  147  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  46.11 
 
 
216 aa  146  2e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  43.52 
 
 
221 aa  145  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  47.22 
 
 
204 aa  145  4e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  43.75 
 
 
220 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  43.75 
 
 
220 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  43.52 
 
 
221 aa  144  7e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  45.05 
 
 
221 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  44.44 
 
 
191 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  42 
 
 
230 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  43.58 
 
 
216 aa  133  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  43.58 
 
 
216 aa  133  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  43.58 
 
 
218 aa  132  4e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
213 aa  76.3  3e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 
197 aa  67.4  1e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
199 aa  64.7  7e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 
196 aa  63.2  2e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
203 aa  58.5  6e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
212 aa  57  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
205 aa  57  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
196 aa  56.6  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  6.55293e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
212 aa  56.2  3e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 
195 aa  56.2  3e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  8.53805e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>