78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1189 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  98.61 
 
 
216 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  50 
 
 
231 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  49.44 
 
 
240 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  44.55 
 
 
228 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  44.57 
 
 
233 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.02 
 
 
248 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  44.06 
 
 
371 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  42.51 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  42.31 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  40.57 
 
 
233 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  41.28 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  42.21 
 
 
222 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  42.21 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  42.14 
 
 
177 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  41.05 
 
 
228 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.98 
 
 
177 aa  121  9e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  45.33 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  50 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  44.67 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  43.45 
 
 
172 aa  119  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  42.22 
 
 
243 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  41.14 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  47.01 
 
 
190 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  39.86 
 
 
183 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  42.76 
 
 
215 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  42 
 
 
248 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  43.71 
 
 
189 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  46.72 
 
 
174 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  41.67 
 
 
220 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  47.22 
 
 
185 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  40.27 
 
 
240 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  42.86 
 
 
235 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  37.36 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  40.14 
 
 
144 aa  98.6  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  43.71 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  40.91 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  43.71 
 
 
187 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  39.49 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  44.78 
 
 
156 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  44.78 
 
 
156 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  43.62 
 
 
157 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  45.71 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  45.8 
 
 
159 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  44.44 
 
 
184 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  41.72 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  32.7 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  42 
 
 
149 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  38.99 
 
 
579 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  33.11 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  42.55 
 
 
139 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  34.64 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  32.64 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  33.55 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  39.44 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  32.64 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  30.41 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  32.9 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  32.9 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.4 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  31.72 
 
 
526 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  31.72 
 
 
526 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  31.72 
 
 
526 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  29.61 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  37.21 
 
 
646 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  25 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  31.2 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  29.81 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  35.85 
 
 
659 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  35.19 
 
 
649 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  35.14 
 
 
645 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  35.14 
 
 
645 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  35.14 
 
 
645 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  30.77 
 
 
661 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  30.77 
 
 
661 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  28.71 
 
 
612 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  26.8 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0696  peptidase U35 phage prohead HK97  25.69 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2787e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>