248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02090 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  98.32 
 
 
416 aa  797  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  87.74 
 
 
416 aa  679  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  87.98 
 
 
416 aa  694  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  88.22 
 
 
416 aa  696  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  87.98 
 
 
416 aa  694  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  813  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  98.56 
 
 
415 aa  764  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  88.7 
 
 
416 aa  707  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  88.22 
 
 
416 aa  696  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  99.04 
 
 
416 aa  803  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  88.22 
 
 
416 aa  696  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  99.28 
 
 
416 aa  805  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  99.52 
 
 
416 aa  806  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  87.98 
 
 
416 aa  694  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  100 
 
 
416 aa  813  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  98.8 
 
 
416 aa  801  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  55.11 
 
 
425 aa  454  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  55.11 
 
 
425 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  54.01 
 
 
424 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  54.01 
 
 
424 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  54.01 
 
 
424 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  53.77 
 
 
424 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  53.77 
 
 
424 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  53.07 
 
 
426 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  53.9 
 
 
424 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  53.54 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  53.9 
 
 
424 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  53.9 
 
 
424 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  53.9 
 
 
424 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  49.18 
 
 
427 aa  406  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  49.29 
 
 
422 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  48.36 
 
 
420 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  49.53 
 
 
422 aa  400  1e-110  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.31 
 
 
413 aa  400  1e-110  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  47.04 
 
 
422 aa  400  1e-110  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  51.06 
 
 
427 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.24 
 
 
416 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  52.24 
 
 
416 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  50.59 
 
 
427 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.91 
 
 
416 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  47.78 
 
 
420 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  47.54 
 
 
420 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  49.18 
 
 
425 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  50.64 
 
 
415 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  47.65 
 
 
419 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  49.28 
 
 
419 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50 
 
 
418 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  49.17 
 
 
423 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  48.94 
 
 
423 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  48.94 
 
 
423 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  48.59 
 
 
419 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  47.18 
 
 
419 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  47.82 
 
 
403 aa  358  1e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  48.59 
 
 
419 aa  358  1e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  48.12 
 
 
419 aa  358  1e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  48.59 
 
 
419 aa  357  2e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  47.65 
 
 
419 aa  355  7e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  48.46 
 
 
419 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.22 
 
 
416 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  47.42 
 
 
419 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  50.12 
 
 
425 aa  352  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  46.75 
 
 
414 aa  352  6e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  46.6 
 
 
402 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  47.18 
 
 
419 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  47.18 
 
 
419 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  45.69 
 
 
420 aa  352  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  47.89 
 
 
419 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  49.88 
 
 
425 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  46.95 
 
 
419 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  49.11 
 
 
416 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  44.1 
 
 
406 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  45.79 
 
 
432 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.27 
 
 
406 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  44.74 
 
 
417 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  46.4 
 
 
408 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  46.52 
 
 
414 aa  338  1e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  43.61 
 
 
402 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  43.27 
 
 
404 aa  332  7e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  42.37 
 
 
402 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  42.37 
 
 
402 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  44.84 
 
 
408 aa  328  1e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.52 
 
 
418 aa  327  2e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  42.13 
 
 
402 aa  327  2e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.13 
 
 
402 aa  327  2e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  42.31 
 
 
403 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  41.2 
 
 
402 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  44.53 
 
 
403 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  39.86 
 
 
419 aa  318  8e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  42.48 
 
 
402 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  42.75 
 
 
401 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  42.44 
 
 
408 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  42.68 
 
 
408 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  41.63 
 
 
402 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  40.68 
 
 
405 aa  314  2e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  43.8 
 
 
403 aa  313  3e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  43.9 
 
 
403 aa  313  3e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  40.92 
 
 
399 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  43.03 
 
 
415 aa  304  2e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  43.03 
 
 
403 aa  303  3e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  39.81 
 
 
401 aa  303  5e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>