252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1616 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  67.11 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  52.89 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  52.68 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  42.86 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  46.36 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  36.76 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  37.86 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  37.88 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  35.44 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  37.69 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  36.36 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  37.35 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  38.81 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  37.57 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  35.75 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  43.56 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  28.5 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.24 
 
 		 626 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  32.68 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  34.4 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.88 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  31.72 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  32.97 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  34.33 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  34.08 
 
 		 307 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  39.29 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  34.34 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  34.95 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.98 
 
 		 464 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  29.47 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  39.33 
 
 		 306 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  35.27 
 
 		 464 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.73 
 
 		 464 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  39.02 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  32.49 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  38.93 
 
 		 306 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  31.38 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.41 
 
 		 481 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1508  siroheme synthase  31.16 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.359282  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  33.82 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  30.81 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  33.95 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  35.12 
 
 		 246 aa  88.6  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  30.25 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.98 
 
 		 462 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.57 
 
 		 489 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  32.79 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  34.46 
 
 		 303 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  33.56 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  33.65 
 
 		 467 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  31.07 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.17 
 
 		 464 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  35.37 
 
 		 303 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.19 
 
 		 484 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.11 
 
 		 800 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  33.81 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  33.17 
 
 		 465 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  37.58 
 
 		 303 aa  84.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.54 
 
 		 464 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  31.55 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.17 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.93 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.5 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.45 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  35.76 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  35.81 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.45 
 
 		 463 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  41.56 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.1 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  33.56 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.76 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  33.93 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.83 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  33.93 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  28.36 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  36.36 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  30.48 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  34.46 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 		 837 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  28.91 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  34.01 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  33.33 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 		 473 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  34.01 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  33.33 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  31.54 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  34.01 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.06 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  30.61 
 
 		 157 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  30.61 
 
 		 157 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  34.01 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  33.33 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.31 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  28.97 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>