More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0308 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 440 aa  891    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  69.21 
 
 		 620 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  60.82 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  57.8 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  48.5 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  49.26 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  42.35 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 		 357 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.55 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  39.24 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  41.33 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  38.21 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  42.33 
 
 		 377 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  41.38 
 
 		 328 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 336 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  39.14 
 
 		 345 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  40.53 
 
 		 323 aa  200  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  37.83 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 331 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  41.08 
 
 		 337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  41.21 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  43.51 
 
 		 343 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  40.66 
 
 		 339 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  42.53 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.71 
 
 		 349 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  43.04 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 333 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 336 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 336 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 341 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  42.6 
 
 		 334 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  39.04 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  36.04 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  38.83 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  35.88 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 		 358 aa  183  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 337 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.05 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.86 
 
 		 340 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  36.05 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.56 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  38.28 
 
 		 345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  39.52 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  37.87 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  36.8 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.14 
 
 		 379 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  38.56 
 
 		 340 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 345 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.57 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  36.01 
 
 		 406 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  35.65 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.86 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  36.16 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 336 aa  173  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.24 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>