More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3142 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
430 aa  865    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  66.83 
 
 
415 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.14 
 
 
427 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  47.38 
 
 
410 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  44.36 
 
 
411 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  41.6 
 
 
2401 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
525 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 
1268 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
832 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
327 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
703 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
1435 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
1739 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
710 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
717 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
717 aa  123  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
988 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 
1340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
1152 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
1152 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
880 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  37.34 
 
 
1077 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
857 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
742 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
996 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
725 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
294 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.31 
 
 
1182 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
1067 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  36.02 
 
 
632 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
1486 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.22 
 
 
700 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
742 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
742 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
624 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
732 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
790 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
983 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
725 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
576 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
746 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
1162 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  33.49 
 
 
1119 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
683 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
662 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
1038 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
1523 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28 
 
 
731 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
1523 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
1509 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
337 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  32.91 
 
 
810 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
311 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
632 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
684 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.33 
 
 
1644 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.33 
 
 
1644 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
785 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
1334 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
753 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
290 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
619 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
958 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
1359 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
679 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
748 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
1759 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
721 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
273 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
625 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
625 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
289 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
313 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.11 
 
 
1561 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
282 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
1275 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
557 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
994 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
305 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
733 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
1106 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
617 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
794 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
902 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
305 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
749 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
298 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.71 
 
 
860 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
775 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
684 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
616 aa  93.2  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
293 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
728 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
551 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
328 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>