75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1656 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  62.82 
 
 
250 aa  269  3e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  58.22 
 
 
243 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  40.95 
 
 
228 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  43.51 
 
 
371 aa  135  6e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  41.04 
 
 
216 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  43.22 
 
 
240 aa  133  2e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  40.57 
 
 
216 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  41.2 
 
 
231 aa  127  1e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  41.87 
 
 
233 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  42.79 
 
 
222 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  42.79 
 
 
222 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.7 
 
 
248 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  41.51 
 
 
174 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  39.46 
 
 
219 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  40.57 
 
 
177 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  40.57 
 
 
177 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 
185 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  33.89 
 
 
183 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  40.69 
 
 
183 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  40.27 
 
 
144 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  36.59 
 
 
172 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  39.35 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  41.96 
 
 
156 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  41.96 
 
 
156 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  41.96 
 
 
157 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  38.04 
 
 
189 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  35.19 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  39.46 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  39.63 
 
 
187 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  37.16 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  38.67 
 
 
235 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  36.77 
 
 
215 aa  84.3  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  39.02 
 
 
187 aa  84.3  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  36.59 
 
 
228 aa  84.3  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  34.73 
 
 
176 aa  83.6  2e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  35.22 
 
 
244 aa  82.8  4e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  35.22 
 
 
220 aa  82.4  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  36.36 
 
 
177 aa  80.5  2e-14  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  35.33 
 
 
240 aa  80.5  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  36.18 
 
 
177 aa  80.1  3e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  39.46 
 
 
187 aa  79.7  3e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  36.67 
 
 
177 aa  80.1  3e-14  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  36.91 
 
 
190 aa  79.3  5e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  41.04 
 
 
159 aa  79  6e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  35.12 
 
 
171 aa  78.6  9e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  37.5 
 
 
184 aa  77.8  1e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  42 
 
 
139 aa  77  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  35.57 
 
 
165 aa  75.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  35.48 
 
 
213 aa  72.4  5e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.74 
 
 
165 aa  72.4  6e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  34.21 
 
 
168 aa  69.7  4e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  29.52 
 
 
180 aa  68.6  8e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  36.02 
 
 
579 aa  68.2  1e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  31.65 
 
 
165 aa  67.4  2e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  31.65 
 
 
165 aa  67.4  2e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  66.6  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  32.6 
 
 
198 aa  62  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32.92 
 
 
526 aa  57  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32.92 
 
 
526 aa  57  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32.92 
 
 
526 aa  57  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.25 
 
 
248 aa  55.8  6e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  32.67 
 
 
149 aa  55.5  7e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  26.6 
 
 
220 aa  53.9  2e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  26.6 
 
 
220 aa  53.9  2e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  30.77 
 
 
150 aa  50.1  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  27.71 
 
 
194 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  27.71 
 
 
194 aa  49.3  5e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  27.71 
 
 
194 aa  49.3  5e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  29.63 
 
 
514 aa  48.9  6e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  28.21 
 
 
562 aa  48.9  7e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  27.71 
 
 
194 aa  48.9  7e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  29.95 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  38.96 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0541  hypothetical protein  46.3 
 
 
118 aa  45.1  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>