113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0890 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  55.47 
 
 		 125 aa  140  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  70.65 
 
 		 92 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  53.78 
 
 		 130 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  45.9 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.96 
 
 		 116 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.87 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  31.09 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  43.18 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.72 
 
 		 115 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 117 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  30.23 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  30.23 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.07 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  26.98 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  36.23 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.1 
 
 		 116 aa  53.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  41.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41.57 
 
 		 133 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.78 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 115 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  40.66 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  32.94 
 
 		 126 aa  51.2  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  41.94 
 
 		 121 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  28.38 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.88 
 
 		 115 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.88 
 
 		 115 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  42.86 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  31.09 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 109 aa  48.5  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  42.7 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32.97 
 
 		 130 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  32.21 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.77 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  38.54 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.5 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  35.56 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  30.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  30.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 385 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  40.3 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  41.89 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  38.75 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 116 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  35.56 
 
 		 127 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  33.8 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  40 
 
 		 119 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 123 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  24.3 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  30.83 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  35.87 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  29.66 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  37.36 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  40.62 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  38.46 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  50 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  31.43 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  31.58 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  34.88 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>