More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1234 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 366 aa  714    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  41.18 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  39.45 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  38.95 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  42.52 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  42.36 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  40.94 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  39.49 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.44 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  40.5 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  39.17 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  38.82 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  38.75 
 
 		 370 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.06 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 426 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  40.19 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.55 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  39.44 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  39.22 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.26 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  39.88 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  34.47 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  39.56 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  36.27 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.04 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  38.77 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  39.63 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  39.63 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  39.88 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  39.88 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  39.88 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  39.88 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  39.88 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  38.94 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  39.88 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  38.94 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  38.53 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  39.56 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  38.94 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  39.56 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  39.56 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 366 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.25 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  38.94 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  38.94 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  38.78 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  38.94 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>