More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3086 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  72.38 
 
 
493 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  100 
 
 
490 aa  934    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  69.12 
 
 
501 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  65.88 
 
 
506 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  58.37 
 
 
492 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  58.2 
 
 
494 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  58.72 
 
 
492 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  49.71 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  50.7 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  45.11 
 
 
609 aa  362  6e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  49.41 
 
 
471 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  49.22 
 
 
472 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  47.52 
 
 
492 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  47.15 
 
 
405 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  45.95 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  45.02 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  45.99 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  45.45 
 
 
467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  43.69 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  44.14 
 
 
486 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  44.86 
 
 
468 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  43.62 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  43.29 
 
 
404 aa  310  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  42.97 
 
 
488 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  42.53 
 
 
517 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  42.8 
 
 
483 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  43.89 
 
 
482 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  42.52 
 
 
492 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  43.09 
 
 
484 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  41.95 
 
 
516 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  43.89 
 
 
481 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  41.02 
 
 
498 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  42.48 
 
 
485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  40.12 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  39.92 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  39.66 
 
 
505 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  38.21 
 
 
502 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  38.87 
 
 
412 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  39.29 
 
 
505 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  55.43 
 
 
388 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  36.81 
 
 
387 aa  230  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  51.84 
 
 
395 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  33.76 
 
 
513 aa  223  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  55.34 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  72.61 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  58.1 
 
 
276 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  64.71 
 
 
431 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  68.79 
 
 
387 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  62.94 
 
 
437 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  62.02 
 
 
280 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  66.24 
 
 
393 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  39.28 
 
 
687 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  65.61 
 
 
394 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  58.08 
 
 
402 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  61.54 
 
 
279 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  63.1 
 
 
375 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  56.76 
 
 
580 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  56.89 
 
 
375 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  64.97 
 
 
272 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  64.33 
 
 
272 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  61.45 
 
 
279 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  52.85 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  65.82 
 
 
294 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  52.31 
 
 
294 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  61.78 
 
 
272 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  56.45 
 
 
282 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  56.35 
 
 
412 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  56.29 
 
 
376 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  58.08 
 
 
377 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  63.82 
 
 
286 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  63.82 
 
 
287 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  32.5 
 
 
499 aa  187  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  58.29 
 
 
278 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  31.8 
 
 
519 aa  186  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  56.29 
 
 
377 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  51.04 
 
 
376 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  56.29 
 
 
379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  65.99 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  65.99 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  57.4 
 
 
379 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  60.12 
 
 
380 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  57.81 
 
 
398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  57.49 
 
 
377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  56.29 
 
 
377 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  57.49 
 
 
377 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  55.69 
 
 
377 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  55.69 
 
 
377 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
278 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.87 
 
 
271 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  57.49 
 
 
587 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  55.69 
 
 
377 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  60.51 
 
 
272 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.87 
 
 
271 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  60.51 
 
 
272 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  55.09 
 
 
377 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  56.29 
 
 
378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  63.06 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  34.8 
 
 
481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  52.12 
 
 
385 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  53.29 
 
 
384 aa  180  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>