More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2009 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  79.17 
 
 
153 aa  212  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  69.18 
 
 
152 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  60.96 
 
 
147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.69 
 
 
157 aa  146  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  51.09 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.41 
 
 
163 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  50.37 
 
 
151 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52 
 
 
156 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  46.85 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  36.92 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.06 
 
 
150 aa  117  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.38 
 
 
155 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.38 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.89 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.44 
 
 
161 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.38 
 
 
223 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  39.85 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  37.59 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.54 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
152 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.93 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.69 
 
 
160 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.5 
 
 
158 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.52 
 
 
158 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.5 
 
 
163 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.44 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.13 
 
 
161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.26 
 
 
157 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.46 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  37.59 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.8 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  34.46 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.66 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.84 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  43.97 
 
 
186 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.04 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.53 
 
 
160 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.9 
 
 
159 aa  90.1  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.66 
 
 
164 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  45.38 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  34.23 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  45.1 
 
 
151 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.29 
 
 
164 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
193 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.08 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  32.79 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  41.13 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
484 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  36.21 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.68 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.31 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  42.57 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.7 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  43.01 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.27 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.61 
 
 
524 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.81 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.91 
 
 
214 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.62 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.8 
 
 
182 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  40.21 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
361 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.46 
 
 
361 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.31 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.62 
 
 
521 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  27.22 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  38.54 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.64 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.37 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.98 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  40.21 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  36.59 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.21 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.38 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.41 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.11 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.27 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  36.7 
 
 
222 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.9 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.18 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  34.96 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  34.96 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  40.4 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  49.37 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.68 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>