114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2263 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  100 
 
 
453 aa  926    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  42.65 
 
 
491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  41.27 
 
 
456 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  45.95 
 
 
474 aa  346  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  33.63 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  34.73 
 
 
503 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  31.72 
 
 
458 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  31.83 
 
 
436 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  30.99 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  31.55 
 
 
439 aa  210  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  32.16 
 
 
491 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  30.56 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  31.6 
 
 
520 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  30.36 
 
 
481 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  29.04 
 
 
569 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  28.5 
 
 
520 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  37.83 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  38.26 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  38.7 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  38.7 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  31.41 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  38.7 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  38.7 
 
 
420 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  38.7 
 
 
420 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  38.7 
 
 
420 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  32.59 
 
 
489 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  38.26 
 
 
420 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  29.36 
 
 
518 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  37.83 
 
 
420 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  36.78 
 
 
748 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  48.95 
 
 
600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  35.43 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  35.35 
 
 
604 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  34.88 
 
 
608 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  30.87 
 
 
559 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  34.88 
 
 
393 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  28.89 
 
 
781 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  29.01 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  28.85 
 
 
420 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  29.43 
 
 
620 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  36.64 
 
 
319 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  34.96 
 
 
248 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  33.46 
 
 
403 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  34.75 
 
 
279 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  43.15 
 
 
305 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  30.6 
 
 
450 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  28.11 
 
 
636 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  33.76 
 
 
582 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  34.98 
 
 
253 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  32.75 
 
 
314 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  36.68 
 
 
576 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  33.2 
 
 
591 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  27.98 
 
 
636 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  31.38 
 
 
580 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  31.41 
 
 
1016 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  35.32 
 
 
219 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  34.57 
 
 
319 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.93 
 
 
675 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  28.57 
 
 
594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  31.78 
 
 
738 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  28.95 
 
 
690 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  29.37 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  30.6 
 
 
579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  40.67 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  41.61 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  40.67 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  49.56 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  31.9 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  37.95 
 
 
642 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  40.67 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  42.54 
 
 
303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  42.54 
 
 
303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  38.1 
 
 
550 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  30.43 
 
 
337 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  37.57 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  27.68 
 
 
670 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  48.72 
 
 
296 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  41.84 
 
 
304 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  33.33 
 
 
686 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  33.2 
 
 
567 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  32.23 
 
 
580 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  36.81 
 
 
633 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  31.45 
 
 
480 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  29.39 
 
 
847 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  31.95 
 
 
892 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  27.3 
 
 
772 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  27.99 
 
 
617 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  25.39 
 
 
677 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  34.12 
 
 
565 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  26.78 
 
 
776 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  29.44 
 
 
633 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.15 
 
 
765 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  39.23 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  29.72 
 
 
682 aa  91.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  32.19 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>