More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0289 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  94.16 
 
 		 137 aa  265  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  89.05 
 
 		 137 aa  253  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  86.86 
 
 		 137 aa  241  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  84.67 
 
 		 137 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  84.67 
 
 		 137 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  80.29 
 
 		 137 aa  234  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  82.84 
 
 		 137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  82.09 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  82.09 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  81.34 
 
 		 137 aa  230  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  81.34 
 
 		 137 aa  225  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  81.34 
 
 		 137 aa  225  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  80.6 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  77.61 
 
 		 137 aa  220  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  77.61 
 
 		 137 aa  221  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  78.36 
 
 		 137 aa  219  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  77.21 
 
 		 146 aa  218  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 144 aa  214  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  75.37 
 
 		 137 aa  213  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  75.37 
 
 		 137 aa  213  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  75.37 
 
 		 137 aa  213  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 138 aa  205  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 137 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  70.54 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  78.36 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  193  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000239067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0177  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000896692  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0155  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000013379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 137 aa  184  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  182  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  180  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 136 aa  180  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  179  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000850628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>