More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0054 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.55 
 
 		 195 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  57.87 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  53.65 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.5 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.62 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.62 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  34.34 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.62 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  37.19 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.59 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.59 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  39 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.31 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.06 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.68 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  35.2 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.41 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  32.98 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.65 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  34.65 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50056  predicted protein  29.38 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  29.7 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  30.5 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  30.37 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  29.35 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.94 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  31.02 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  29.47 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  32.23 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.72 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  29.21 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  30.93 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  34.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  28.12 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  30.3 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  32.31 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  27.94 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  33.82 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  29.58 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  28.37 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  27.8 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  29.15 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.53 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  29.19 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  31.64 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  27.01 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.96 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  28.92 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  30.56 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  29.9 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.72 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  29.41 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  29.38 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  28.12 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  30.39 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  30.85 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  29.32 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  30.23 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  29.06 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  28.37 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  28.3 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  27.86 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  27.62 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>