More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2006 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 329 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  46.42 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  43.88 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  42.66 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  43.15 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.68 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.21 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  31.46 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  35.5 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  38.71 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.84 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  31.91 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  31.94 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.1 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 		 340 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  33.87 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.18 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  39.11 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32.8 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.17 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.95 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  30.64 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.86 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  36.68 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.61 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.44 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  30.29 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  38.6 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  38.38 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  35.54 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 346 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.82 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  32.68 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.23 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  34.34 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.22 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  33.03 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.4 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  33.03 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  31.23 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  34.98 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  34.56 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.4 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.68 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  34.95 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  30.89 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  32.14 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.21 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  34.11 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.21 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  35.05 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.97 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  32.2 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  34.27 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  30.06 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  29.3 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  30.23 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  31.61 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>