171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1220 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  100 
 
 
593 aa  1201  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.21334e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  55.18 
 
 
593 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  47.61 
 
 
582 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  47.18 
 
 
580 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  45.76 
 
 
611 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  5.53707e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  45.73 
 
 
579 aa  461  1e-128  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  47.29 
 
 
580 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  46.76 
 
 
579 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  44.82 
 
 
430 aa  285  1e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  45.01 
 
 
436 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  35.79 
 
 
418 aa  218  3e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  35.97 
 
 
569 aa  201  4e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  37.07 
 
 
416 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  35.13 
 
 
421 aa  194  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  33.33 
 
 
419 aa  191  3e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  35.79 
 
 
375 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  34.91 
 
 
442 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  31.59 
 
 
442 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  37.99 
 
 
379 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  33.43 
 
 
347 aa  147  8e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  33.08 
 
 
391 aa  142  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  30.03 
 
 
436 aa  142  1e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  28.75 
 
 
434 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  27.14 
 
 
449 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  29.57 
 
 
445 aa  132  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  29.3 
 
 
445 aa  132  2e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  31.09 
 
 
348 aa  124  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  26.38 
 
 
473 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  24.94 
 
 
473 aa  120  5e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  31.99 
 
 
390 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  28.01 
 
 
492 aa  118  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  29.7 
 
 
445 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  30.37 
 
 
487 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  2.10217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  30.47 
 
 
423 aa  114  4e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  3.9594e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  30 
 
 
450 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.3133e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  27.07 
 
 
479 aa  112  2e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  27.78 
 
 
489 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  27.63 
 
 
498 aa  104  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  29.08 
 
 
483 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  27.82 
 
 
480 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  3.1212e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  28.02 
 
 
473 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  28.64 
 
 
478 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  27.71 
 
 
334 aa  97.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  27.55 
 
 
493 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.78324e-07  hitchhiker  8.01244e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.84 
 
 
352 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  30.18 
 
 
467 aa  93.2  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  28.71 
 
 
472 aa  91.3  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  30.21 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  26.4 
 
 
357 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  25.9 
 
 
331 aa  84.7  4e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  25.85 
 
 
374 aa  84.3  5e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  25.29 
 
 
369 aa  77.4  7e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  25.57 
 
 
327 aa  76.6  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  27.87 
 
 
348 aa  76.6  1e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.32 
 
 
369 aa  74.7  5e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  73.6  1e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  72  3e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  27.43 
 
 
360 aa  70.5  8e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67.4  6e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.79624e-06  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  25.49 
 
 
368 aa  67.4  6e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.52069e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  24.86 
 
 
349 aa  67  8e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  25.14 
 
 
349 aa  67  8e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  25.95 
 
 
361 aa  66.6  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  28.12 
 
 
360 aa  66.2  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29603e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.44 
 
 
335 aa  65.9  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  23.51 
 
 
346 aa  63.9  9e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  22.73 
 
 
361 aa  63.5  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  22.73 
 
 
361 aa  63.5  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  29.44 
 
 
331 aa  63.5  1e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  25.52 
 
 
356 aa  63.5  1e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  27.36 
 
 
239 aa  62.4  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.59953e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  24.57 
 
 
356 aa  62.8  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  26.76 
 
 
360 aa  62.8  2e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  26.76 
 
 
360 aa  62.8  2e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  25.17 
 
 
356 aa  62.8  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  25.17 
 
 
356 aa  62.8  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.17 
 
 
339 aa  62.4  2e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  21.63 
 
 
357 aa  62  3e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  22.68 
 
 
359 aa  61.6  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  24.1 
 
 
420 aa  61.2  5e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  23.44 
 
 
346 aa  60.8  7e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  24.05 
 
 
349 aa  60.1  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  24.05 
 
 
349 aa  60.1  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  24.05 
 
 
349 aa  60.1  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  24.05 
 
 
349 aa  60.1  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  24.05 
 
 
349 aa  60.1  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  22.67 
 
 
365 aa  59.7  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  24.7 
 
 
361 aa  60.5  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  23.98 
 
 
355 aa  59.3  2e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  22.65 
 
 
360 aa  58.2  4e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  25.47 
 
 
348 aa  58.2  4e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  22.65 
 
 
360 aa  58.2  4e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  28.44 
 
 
366 aa  57.8  5e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  24.19 
 
 
362 aa  57.4  7e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>