68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2603 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  75.31 
 
 
487 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  951    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  55.62 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  46.45 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  43.03 
 
 
498 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  42.65 
 
 
479 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  40.99 
 
 
489 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  39.04 
 
 
480 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  41.42 
 
 
473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  41.13 
 
 
478 aa  288  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  41.54 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  55.67 
 
 
239 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  38.14 
 
 
348 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  33.47 
 
 
467 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  29.31 
 
 
449 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  33.47 
 
 
467 aa  126  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  28.79 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  34.25 
 
 
569 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  29.36 
 
 
473 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  33.23 
 
 
416 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  30.79 
 
 
442 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  27.07 
 
 
419 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  28.39 
 
 
473 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  28.68 
 
 
418 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  28.07 
 
 
434 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  29.61 
 
 
436 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  32.14 
 
 
579 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  32.98 
 
 
580 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  27.86 
 
 
430 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  30.36 
 
 
445 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  30.36 
 
 
445 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  30.46 
 
 
580 aa  96.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  30.29 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  29.65 
 
 
579 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  32.93 
 
 
593 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  30.2 
 
 
593 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  31.15 
 
 
611 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  31.87 
 
 
582 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  29.02 
 
 
445 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  31.65 
 
 
379 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  27.1 
 
 
450 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  32.28 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  29.71 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  26.22 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  25.97 
 
 
357 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  33.47 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  25.91 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  28.87 
 
 
347 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  26.42 
 
 
331 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  25.95 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  30.1 
 
 
360 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  28.21 
 
 
360 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.28 
 
 
369 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  21.64 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  27.08 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.38 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  29.01 
 
 
336 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  25.12 
 
 
343 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  21.82 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  25.65 
 
 
369 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  30.94 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  27.7 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  27.74 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  27.74 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  26.97 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  22.97 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  22.8 
 
 
338 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  23.91 
 
 
340 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>