78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2092 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  946    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  63.39 
 
 		 480 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  55 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  57.67 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  53.48 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  53.68 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  42.06 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  44.12 
 
 		 478 aa  352  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  42.65 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  40.12 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  44.26 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  63.55 
 
 		 239 aa  269  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  34.55 
 
 		 348 aa  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  29.62 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  30.42 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  30.63 
 
 		 416 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  31.8 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  31.58 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  28.79 
 
 		 593 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  25.9 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  30.68 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  28.6 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  29.2 
 
 		 579 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  28.04 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  28.92 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  28.92 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  27 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  28.62 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  28.47 
 
 		 579 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  28.13 
 
 		 611 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  27.1 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  27.04 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  29.79 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  27.14 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  26.86 
 
 		 580 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  28.12 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  29.62 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  27.32 
 
 		 580 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  27.25 
 
 		 593 aa  90.1  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  30.27 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  29.36 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  27.64 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  27.04 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.03 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.13 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  24.43 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  25.41 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  27.22 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.95 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.67 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  25.94 
 
 		 331 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  24.07 
 
 		 360 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  23.91 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  23.53 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  25.09 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  24.7 
 
 		 374 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  27.27 
 
 		 343 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  26.29 
 
 		 360 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  27 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  22.46 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.8 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  25.44 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  26.44 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  26.76 
 
 		 355 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  29.36 
 
 		 340 aa  47  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  24.85 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  25.5 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  26.37 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  26.37 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  24.43 
 
 		 325 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  24.77 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  25.79 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  24.59 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  27.67 
 
 		 327 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>