More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2846 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  100 
 
 		 236 aa  453  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  75.32 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  74.36 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  74.36 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  74.36 
 
 		 273 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  73.93 
 
 		 273 aa  331  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  73.93 
 
 		 278 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  71.49 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  65.38 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  65.38 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  63.9 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  63.64 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  63.25 
 
 		 274 aa  296  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  64.85 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  60.17 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  61.37 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  58.75 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  65.45 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  58.52 
 
 		 242 aa  266  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  56.84 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  56.84 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  56.9 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  61.09 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  62.33 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  57.98 
 
 		 243 aa  255  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  53.33 
 
 		 255 aa  254  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  56.9 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  54.91 
 
 		 232 aa  251  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  54.27 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  59.65 
 
 		 241 aa  247  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  54.89 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  52.38 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  51.52 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  50.65 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  51.52 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  57.46 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  52.73 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  53.33 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  52.56 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  51.83 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  51.83 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  51.83 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  52.29 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  55.86 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  54.51 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  50.92 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  50.92 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  55.42 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  51.54 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  53.19 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  54.35 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  50.88 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  49.79 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  52.4 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  51.68 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  50.21 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  47.46 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  45.61 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  48.73 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  50.21 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  43.75 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  52.19 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  51.33 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  45.38 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  48.66 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  38.83 
 
 		 282 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  37.37 
 
 		 287 aa  174  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  47.26 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  37.82 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  39.09 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  47.23 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  43.7 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  45.76 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  44.21 
 
 		 274 aa  161  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  46.81 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  40.47 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.22 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  46.78 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  45.05 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  39.92 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  43.88 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  43.88 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  42.86 
 
 		 284 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  39.02 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  39.75 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  39.34 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  41.25 
 
 		 275 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>