98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1427 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  83.88 
 
 
426 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  848    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  67.29 
 
 
443 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  56.71 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  59.08 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  57.35 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  58.55 
 
 
420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  62.3 
 
 
415 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  58.31 
 
 
417 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  34.35 
 
 
349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  34.76 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  33.52 
 
 
352 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  32.23 
 
 
356 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  34.14 
 
 
360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  31.09 
 
 
361 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
362 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  34.18 
 
 
394 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  30.37 
 
 
346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.68 
 
 
350 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
305 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 
312 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.73 
 
 
296 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.02 
 
 
350 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.23 
 
 
307 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
303 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.88 
 
 
356 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.82 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.58 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  31.89 
 
 
339 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.23 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.25 
 
 
308 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.85 
 
 
306 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.8 
 
 
310 aa  94  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 
307 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  31.87 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 
307 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
320 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  29.23 
 
 
330 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.15 
 
 
308 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.85 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.47 
 
 
307 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.14 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.02 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  27.54 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  29.79 
 
 
307 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.59 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.25 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.1 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  26.6 
 
 
308 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  33.17 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.94 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.63 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.14 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  26.56 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  26.14 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.83 
 
 
313 aa  65.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  25.78 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  27.38 
 
 
307 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  32.86 
 
 
2798 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.23 
 
 
255 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.65 
 
 
267 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  28.17 
 
 
277 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
325 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.21 
 
 
300 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  40 
 
 
305 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  25.39 
 
 
261 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  24.02 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  27.87 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  25.39 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  23.69 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  31.68 
 
 
260 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  24.15 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  28.16 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  33.67 
 
 
139 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  25.38 
 
 
261 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  29.66 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  25.37 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  31.86 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  31.86 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  24.73 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  38.55 
 
 
277 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.97 
 
 
266 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.86 
 
 
312 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  23.43 
 
 
323 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  24.68 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  22.43 
 
 
317 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.7 
 
 
260 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>