99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0939 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
329 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  76.19 
 
 
270 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  40.44 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  50 
 
 
746 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  41.29 
 
 
289 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  34.55 
 
 
447 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  35.37 
 
 
763 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  45.61 
 
 
625 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 
153 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  41.38 
 
 
383 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  41.07 
 
 
652 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  44.92 
 
 
751 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  41.07 
 
 
781 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  41.84 
 
 
176 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  35.83 
 
 
458 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  38.33 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  38.74 
 
 
784 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  31.22 
 
 
845 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 
704 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  37.5 
 
 
741 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  41.23 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  40.62 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  36.75 
 
 
758 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  36.61 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  39.66 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  39.78 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  29.88 
 
 
549 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.71 
 
 
1305 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  37.23 
 
 
263 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  34.26 
 
 
749 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
418 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  30.58 
 
 
754 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  30.13 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  31.09 
 
 
1118 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  30.91 
 
 
372 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  30.87 
 
 
501 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  30.95 
 
 
589 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  33.98 
 
 
483 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  28.95 
 
 
481 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
732 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  34.69 
 
 
521 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  35.87 
 
 
216 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  30.27 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  36.46 
 
 
541 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  36.96 
 
 
452 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  28.38 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 
553 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
480 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  33.93 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  33.03 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
547 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  31.17 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  31.58 
 
 
495 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
950 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.73 
 
 
657 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
259 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  29.17 
 
 
1176 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.49 
 
 
657 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  30.43 
 
 
591 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  27.75 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.79 
 
 
431 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  28.12 
 
 
792 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  31.46 
 
 
784 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  27.45 
 
 
514 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  26.51 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  35.96 
 
 
478 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  32.22 
 
 
763 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  25.53 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  30.52 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  31 
 
 
269 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.18 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  35.87 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  33.64 
 
 
182 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  32.71 
 
 
269 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  29.03 
 
 
113 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  25.76 
 
 
487 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  30 
 
 
214 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  32.97 
 
 
763 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  30.69 
 
 
304 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  30.11 
 
 
948 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  32.63 
 
 
292 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  33.66 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  31.78 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  30.95 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.42 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  28.37 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
650 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  30.48 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  25.83 
 
 
529 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  29.03 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  31.82 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  32.22 
 
 
426 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  28.71 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  26.51 
 
 
206 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>