More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0320 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  36.5 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  37.22 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  37.41 
 
 		 409 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  36.04 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  38.58 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  36.02 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  38.58 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  36.1 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33.82 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  34.55 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  35.68 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  35.85 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  33.76 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  35.92 
 
 		 645 aa  209  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  35.12 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  34.59 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  36.09 
 
 		 653 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  33.59 
 
 		 666 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  33.75 
 
 		 644 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  34.42 
 
 		 656 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  35.77 
 
 		 670 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  34.03 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.15 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.5 
 
 		 405 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  31.84 
 
 		 647 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.78 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.69 
 
 		 657 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  34.05 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  35.07 
 
 		 657 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  34.89 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.75 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32.54 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  35.66 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.92 
 
 		 658 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  32.45 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.08 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  34.89 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  32.11 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.68 
 
 		 409 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  31.68 
 
 		 408 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  31.68 
 
 		 401 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  32.34 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.41 
 
 		 651 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  35.34 
 
 		 657 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.97 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  34.06 
 
 		 409 aa  185  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.03 
 
 		 643 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  33.42 
 
 		 652 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.64 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  33.83 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.7 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  28.6 
 
 		 715 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  31.57 
 
 		 654 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.1 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  30.91 
 
 		 656 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  33.66 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  31.8 
 
 		 707 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.54 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.46 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  33.08 
 
 		 661 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.66 
 
 		 654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  32 
 
 		 648 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  32.64 
 
 		 671 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  32.1 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.92 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.02 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.93 
 
 		 678 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  32.58 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29.93 
 
 		 678 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.93 
 
 		 678 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.97 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  31.75 
 
 		 653 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.16 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  33.82 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.92 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30.75 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  32.3 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>