More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2646 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
320 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  71.38 
 
 
321 aa  501  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.87 
 
 
321 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.55 
 
 
321 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.87 
 
 
321 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.87 
 
 
321 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.55 
 
 
321 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  68.87 
 
 
321 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  68.55 
 
 
321 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  68.24 
 
 
321 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  68.55 
 
 
321 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  68.55 
 
 
321 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  68.27 
 
 
323 aa  461  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  66.98 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
368 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  56.53 
 
 
351 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  56.57 
 
 
353 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  52.01 
 
 
394 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  49.15 
 
 
397 aa  362  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  48.99 
 
 
381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  48.71 
 
 
380 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  48.42 
 
 
380 aa  351  8.999999999999999e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.19 
 
 
416 aa  348  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 
416 aa  345  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  46.18 
 
 
364 aa  294  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  46.89 
 
 
375 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.85 
 
 
735 aa  290  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.88 
 
 
352 aa  289  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  47 
 
 
359 aa  288  9e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  46.6 
 
 
368 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  42.6 
 
 
385 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  43.91 
 
 
316 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  43.67 
 
 
337 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.44 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  42.36 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  43.04 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  65.71 
 
 
183 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  42.27 
 
 
346 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  41.25 
 
 
338 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.21 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  61.49 
 
 
174 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  63.16 
 
 
175 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  40.89 
 
 
332 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  61.05 
 
 
198 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.92 
 
 
611 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
178 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  58.99 
 
 
178 aa  225  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  41.23 
 
 
309 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 
178 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 
178 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
178 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  57.3 
 
 
178 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
178 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  70.21 
 
 
153 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
178 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  56.74 
 
 
178 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  56.74 
 
 
178 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
201 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  56.74 
 
 
178 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  71.94 
 
 
187 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  57.06 
 
 
169 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  54.34 
 
 
260 aa  208  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  58.33 
 
 
212 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  52.87 
 
 
174 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  53.49 
 
 
177 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  53.49 
 
 
177 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  56.65 
 
 
211 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 
211 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  55.23 
 
 
175 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  52.27 
 
 
223 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  55.81 
 
 
214 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  36.57 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  69.34 
 
 
158 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  68.61 
 
 
155 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 
141 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  53.8 
 
 
212 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.49 
 
 
311 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
191 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
171 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  52.07 
 
 
242 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  62.04 
 
 
290 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.92 
 
 
322 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  48.88 
 
 
208 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  63.5 
 
 
212 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
180 aa  185  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  63.57 
 
 
167 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  63.57 
 
 
167 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  50.59 
 
 
204 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
208 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  63.04 
 
 
202 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  62.77 
 
 
181 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
148 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  62.86 
 
 
147 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  51.83 
 
 
213 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
153 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  65.15 
 
 
154 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 
198 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  59.44 
 
 
147 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  55.26 
 
 
178 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  65.15 
 
 
157 aa  178  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>