More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2371 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  812    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  69.21 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  69.46 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  69.1 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  66.91 
 
 		 459 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  68.59 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  67.5 
 
 		 461 aa  554  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  67.5 
 
 		 461 aa  554  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  66.08 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  68.33 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  64.94 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  65.34 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  64.59 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  65.34 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  64.59 
 
 		 457 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  62.91 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 493 aa  338  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 442 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.55 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.35 
 
 		 447 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.03 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.16 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  33.25 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  33.25 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  33.25 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  36 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.9 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 461 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  33.74 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.92 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  32.33 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  33.42 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  34.87 
 
 		 443 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.23 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  32.24 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  32.83 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  32.83 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  32.83 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  32.07 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  33.69 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  32.89 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  32.89 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  32.89 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 457 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  37.69 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 457 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  34.16 
 
 		 467 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  32.51 
 
 		 455 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  32.19 
 
 		 459 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  34.56 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  34.48 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  32.81 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  32.14 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  31.39 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  35.13 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  32.64 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  32.64 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>