More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1899 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  47.18 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  42.55 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  45.52 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  45 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  44.06 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.07 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  38.78 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  42.55 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  43.94 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  39.31 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  42.36 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  42.96 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.69 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  38.13 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  37.59 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  40 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  40.29 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  44.36 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40.77 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  46.55 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40.31 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 179 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 181 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.98 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>