More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1305 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 414 aa  820    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  62.86 
 
 		 398 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  58.25 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  59.28 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  57.83 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  58.01 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  57.52 
 
 		 398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  55.69 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  55.45 
 
 		 402 aa  441  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  61.26 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  58.45 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.5 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  57.38 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.21 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.76 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.76 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.76 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.45 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.94 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  58.59 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.83 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.35 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.11 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.97 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.8 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.56 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.81 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.59 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.57 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.49 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.8 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  54.83 
 
 		 400 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.31 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.14 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  55.07 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.87 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.59 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.69 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.09 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.31 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  51.08 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.35 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.8 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.94 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.66 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.11 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.64 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.76 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.11 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.93 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.24 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.92 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.93 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.63 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.86 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.08 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.52 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.35 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.07 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  57.18 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  54.83 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.83 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.83 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.83 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.07 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.14 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2813  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.14 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  53.12 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.07 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  52.4 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.35 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.35 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.8 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.86 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.22 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.05 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.83 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.96 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4437  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.42 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.31 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.28 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.59 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.85 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.72 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.38 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.7 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.42 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.38 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.38 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.14 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.05 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>