47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4554 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  100 
 
 		 346 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  48.99 
 
 		 350 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  40 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  35.86 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  30.77 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  29.76 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  34 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  28.7 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  27.97 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.22 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 		 586 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  31.17 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.77 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  22.96 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  24.76 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.58 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.33 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  24.44 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  29.37 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.15 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  29.03 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.13 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  24.86 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  21.99 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  29.23 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  24.46 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.72 
 
 		 574 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  27.07 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  27.82 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.84 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.99 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  27.91 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.88 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.56 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  36.84 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.08 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  24.81 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  24.79 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  31.53 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  31.53 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  31.53 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  21.9 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>