More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2328 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  56.16 
 
 		 552 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  65.62 
 
 		 549 aa  767    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  72.48 
 
 		 549 aa  842    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  72.99 
 
 		 550 aa  850    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  66.11 
 
 		 548 aa  780    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  65.2 
 
 		 548 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  56.22 
 
 		 568 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  67.16 
 
 		 550 aa  784    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  57.87 
 
 		 552 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  73.31 
 
 		 550 aa  855    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 561 aa  1169    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  54.65 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  56.74 
 
 		 544 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  54.68 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  55.78 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  55.91 
 
 		 560 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  55.62 
 
 		 549 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  53.66 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  54.71 
 
 		 549 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  54.34 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  53.64 
 
 		 550 aa  618  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  55.43 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  54.34 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 		 554 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  52.96 
 
 		 553 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  53.16 
 
 		 563 aa  585  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.74 
 
 		 605 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  49.07 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  46.28 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  48.14 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  46.69 
 
 		 571 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  47.96 
 
 		 546 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  45.49 
 
 		 562 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  46.23 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  47.78 
 
 		 843 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  46.99 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  46.7 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  47.3 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  48.32 
 
 		 605 aa  501  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  46.99 
 
 		 564 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  47.67 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  47.5 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  47.67 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  48.42 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 		 566 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  47.49 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  45.66 
 
 		 557 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  47.69 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  46.06 
 
 		 574 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  44.63 
 
 		 596 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  44.65 
 
 		 584 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  44.63 
 
 		 565 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  46.84 
 
 		 575 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  46.8 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  46.52 
 
 		 564 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  46.72 
 
 		 546 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  46.84 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  45.45 
 
 		 560 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  46.33 
 
 		 565 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  46.64 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  46.18 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  45.56 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  46.24 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  46.67 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  47.96 
 
 		 542 aa  488  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  46.93 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  45.9 
 
 		 570 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  45.9 
 
 		 570 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  46.64 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  46.48 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  46.37 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  46.18 
 
 		 575 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  44.46 
 
 		 602 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  46 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  46.55 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  46 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  45.9 
 
 		 570 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  45.7 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  45.61 
 
 		 561 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  45.59 
 
 		 601 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.39 
 
 		 828 aa  488  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  45.84 
 
 		 1043 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  44.5 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  43.68 
 
 		 587 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  46.49 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  46 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  44.1 
 
 		 538 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  45.19 
 
 		 579 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  45.52 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  46.31 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>