243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0643 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  58.3 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  58.3 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  55.86 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  56.99 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  56.49 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  56.12 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  57.39 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  56.61 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  53.19 
 
 
300 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  56.06 
 
 
316 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  53.02 
 
 
308 aa  272  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  41.26 
 
 
299 aa  186  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.13 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.91 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35.97 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  30.69 
 
 
301 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  31.15 
 
 
301 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
301 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  31.02 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  31.35 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.49 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  31.35 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  31.35 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.35 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  35.47 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  31.35 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  31.02 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  30.03 
 
 
307 aa  119  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  33.45 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  30.8 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
283 aa  112  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  35.91 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.97 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.74 
 
 
304 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
312 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  33.1 
 
 
292 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.11 
 
 
308 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 
252 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.02 
 
 
305 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  32.75 
 
 
296 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  33.01 
 
 
297 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 
302 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  33.09 
 
 
299 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 
312 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.41 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  35.82 
 
 
288 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
301 aa  99  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
293 aa  99  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  34.71 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  33.21 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
290 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  27.86 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  33.8 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  30.98 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.92 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  30.85 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.54 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
308 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  32.29 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  27.97 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  30.2 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.04 
 
 
322 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  33.44 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.41 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.41 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  30.18 
 
 
360 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.13 
 
 
307 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  32.06 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.03 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  28.03 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  30.45 
 
 
307 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  31.71 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  37.43 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  31.36 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  31.71 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.78 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  26.91 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  26.91 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>