More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0069 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
302 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
353 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
1739 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  38.24 
 
 
2401 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
582 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
616 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
679 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
624 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
1268 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
1162 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  29.46 
 
 
860 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.7 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
1523 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
1523 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 
1119 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
785 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
1435 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.23 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.67 
 
 
700 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.56 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  29.65 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
1340 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
841 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1239  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
369 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
722 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28.71 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  24.62 
 
 
312 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
902 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.15 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.34 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
457 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 
427 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
602 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
322 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
617 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
337 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
733 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
366 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.35 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
653 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
455 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  31.25 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
1275 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
670 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
812 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
324 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
625 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
337 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
625 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2876  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
632 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>