More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1934 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
408 aa  833    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  43.53 
 
 
412 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  40.89 
 
 
426 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  39.38 
 
 
596 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0054  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  33.89 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0374  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  31.22 
 
 
480 aa  109  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
348 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.43 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
672 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.15 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
395 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.46 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
689 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.21 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.97 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.46 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  30.71 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  26.56 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  33.8 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  26.14 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  26.46 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.71 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.34 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>