More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1609 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  100 
 
 
291 aa  593  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  55.9 
 
 
293 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  34.64 
 
 
303 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  38.85 
 
 
296 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  32.62 
 
 
305 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  34.44 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  35.66 
 
 
300 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  35.9 
 
 
280 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  37.04 
 
 
290 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  35.04 
 
 
307 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  34.42 
 
 
290 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  35.66 
 
 
299 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  33.33 
 
 
294 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  34.06 
 
 
290 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  32.49 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.49 
 
 
290 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  34.98 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  30.28 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.49 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  32.98 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  32.49 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  35.34 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  33.89 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  33.33 
 
 
291 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.51 
 
 
367 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  33.69 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  32.47 
 
 
289 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  31.49 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  31.25 
 
 
294 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  32.13 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  30.85 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  34.41 
 
 
293 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  33.81 
 
 
299 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  36.19 
 
 
287 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  34.41 
 
 
293 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  30.23 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35.11 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  35 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.61 
 
 
346 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  31.73 
 
 
282 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  31.83 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  31.1 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  31.02 
 
 
283 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  31.9 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  30.63 
 
 
282 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  29.86 
 
 
301 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  30.14 
 
 
287 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  30.98 
 
 
279 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.21 
 
 
341 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  33.33 
 
 
296 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  30.63 
 
 
282 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.21 
 
 
341 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.07 
 
 
341 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.06 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  31.87 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  31.87 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.94 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.06 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  33.45 
 
 
296 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  29.79 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  29.79 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  33.21 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  29.79 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  33.59 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  33.21 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  31.07 
 
 
291 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  30.9 
 
 
288 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  32.05 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  31.67 
 
 
310 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  31.82 
 
 
324 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  34.78 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  31.07 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  28.33 
 
 
347 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  28.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  27.72 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  28.26 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  26.91 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  29.59 
 
 
337 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  29.9 
 
 
309 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  30.8 
 
 
342 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  29.97 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  30.22 
 
 
354 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  30.22 
 
 
354 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  31.09 
 
 
320 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  29.9 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  28.52 
 
 
326 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  28.52 
 
 
326 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  28.52 
 
 
326 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  30.83 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  30.45 
 
 
318 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  30.85 
 
 
320 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  28.87 
 
 
321 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  30.85 
 
 
320 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  30.08 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  29.97 
 
 
322 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>