150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1264 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 855 aa  1768    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  37.93 
 
 		 4917 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  40.54 
 
 		 4844 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  36.06 
 
 		 4979 aa  99.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  36.9 
 
 		 1879 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  32.99 
 
 		 400 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  31.19 
 
 		 315 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  33.33 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  30.54 
 
 		 346 aa  67  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  30.1 
 
 		 418 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.66 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  27.65 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  25.74 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  35.11 
 
 		 322 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  33.08 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.29 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  27.42 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  29.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  34.85 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  27.43 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  34.85 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  25.25 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  27.17 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.58 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  27.18 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  26.8 
 
 		 335 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  26.03 
 
 		 280 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.09 
 
 		 331 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.41 
 
 		 330 aa  55.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  27.72 
 
 		 351 aa  55.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.45 
 
 		 330 aa  55.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.86 
 
 		 373 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.44 
 
 		 267 aa  54.3  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.04 
 
 		 267 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  25 
 
 		 279 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  25 
 
 		 278 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.4 
 
 		 343 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.3 
 
 		 295 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  25 
 
 		 307 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.59 
 
 		 331 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  26.52 
 
 		 267 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.52 
 
 		 291 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.7 
 
 		 328 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.59 
 
 		 331 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.54 
 
 		 331 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.25 
 
 		 264 aa  53.5  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  27.61 
 
 		 267 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  26.37 
 
 		 437 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  24.05 
 
 		 272 aa  52.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.61 
 
 		 267 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  26.63 
 
 		 271 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.85 
 
 		 267 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.99 
 
 		 331 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.99 
 
 		 331 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.56 
 
 		 328 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.78 
 
 		 268 aa  52.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.49 
 
 		 267 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  25.49 
 
 		 267 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  29.45 
 
 		 400 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  29.56 
 
 		 328 aa  51.6  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  29.56 
 
 		 328 aa  51.6  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.82 
 
 		 327 aa  51.6  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.33 
 
 		 290 aa  51.6  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  24.02 
 
 		 307 aa  51.6  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.1 
 
 		 318 aa  51.2  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  27.73 
 
 		 330 aa  51.2  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  24.16 
 
 		 297 aa  51.2  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.97 
 
 		 272 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  22.97 
 
 		 272 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.3 
 
 		 345 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.22 
 
 		 338 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  25.76 
 
 		 268 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.84 
 
 		 334 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.48 
 
 		 364 aa  50.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.65 
 
 		 329 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.74 
 
 		 329 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  27.81 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.48 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  27.27 
 
 		 327 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  30.28 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  24.81 
 
 		 285 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  29.65 
 
 		 328 aa  50.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  25.85 
 
 		 411 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  24.16 
 
 		 297 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.45 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  26.7 
 
 		 330 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  28.74 
 
 		 329 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  24.68 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.92 
 
 		 322 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  22.48 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>