More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2177 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0055  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  hitchhiker  0.000805427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  43.22 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  42.37 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  43.86 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 457 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 456 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 451 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 457 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  44.74 
 
 		 460 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 		 472 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2412  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 454 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.62 
 
 		 466 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.19 
 
 		 462 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.86 
 
 		 461 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  41.74 
 
 		 394 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 478 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  41.74 
 
 		 394 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 448 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 		 486 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  38.66 
 
 		 473 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 393 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  36.84 
 
 		 461 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  40 
 
 		 412 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 460 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 247 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 385 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 461 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 456 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.38 
 
 		 456 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 456 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 688 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 		 457 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  38.26 
 
 		 393 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.26 
 
 		 412 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 129 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.26 
 
 		 393 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  40.35 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1016 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  39.6 
 
 		 368 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 480 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 237 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  41.51 
 
 		 334 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 		 448 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.23 
 
 		 457 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.78 
 
 		 464 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 236 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 397 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 456 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 456 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1603  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 449 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  39.6 
 
 		 368 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 513 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 243 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1055 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  36.84 
 
 		 468 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 476 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  38.14 
 
 		 248 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 819 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0717  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 466 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 243 aa  84.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 487 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 231 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 243 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 255 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>