More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1985 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  511  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  47.66 
 
 
271 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  46.48 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  40.84 
 
 
776 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.85 
 
 
261 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
301 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.28 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
355 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.38 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  41.36 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.79 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
281 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.22 
 
 
248 aa  92  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.21 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.21 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.35 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.42 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.14 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
298 aa  88.6  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
262 aa  89  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  37.87 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  36.88 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.42 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
276 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.52 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.69 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
409 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  30.65 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.71 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.7 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.42 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.42 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.35 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.41 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.4 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  31.61 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  38.22 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  29.65 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  35.67 
 
 
1014 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  29.73 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  29.73 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  40.88 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  39.32 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  38.51 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  35.64 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.14 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
369 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  28.65 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.88 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>