284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1274 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
359 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  50.42 
 
 
360 aa  347  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.42 
 
 
366 aa  346  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  48.02 
 
 
355 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  50.57 
 
 
352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  51.55 
 
 
361 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  50.56 
 
 
361 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  50.56 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  48.88 
 
 
359 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  49.45 
 
 
372 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
357 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
354 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  37.2 
 
 
331 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
367 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
364 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
368 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
371 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  32.18 
 
 
339 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  29.71 
 
 
384 aa  143  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  28.45 
 
 
333 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  29.03 
 
 
1444 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  28.75 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  26.36 
 
 
1121 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.9 
 
 
2401 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
828 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 
407 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  28.04 
 
 
1147 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  27.91 
 
 
1608 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  32.5 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
1265 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1476 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  27.45 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
1292 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
1271 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
428 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  27.6 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
418 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.69 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  27.11 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  25.2 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
409 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
924 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
402 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
419 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  24.07 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
1239 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
393 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
404 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
434 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
3172 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  38.03 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
1303 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  24.59 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.91 
 
 
775 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  27.27 
 
 
679 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  30.49 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  29.79 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>