More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0430 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  1013    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 
515 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
515 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 
515 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 
515 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  50.91 
 
 
526 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 
519 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  49.25 
 
 
517 aa  432  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  47.73 
 
 
523 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.72 
 
 
515 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 
517 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
524 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 
531 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  50.22 
 
 
513 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  47.93 
 
 
505 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  47.73 
 
 
505 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  47.73 
 
 
817 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  48.63 
 
 
499 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  49.46 
 
 
517 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 
517 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  47.52 
 
 
518 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  47.93 
 
 
505 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 
517 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  47.73 
 
 
505 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  51.11 
 
 
517 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.29 
 
 
509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
484 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 
482 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
493 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  45.91 
 
 
518 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  46.93 
 
 
481 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
487 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 
481 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  45.53 
 
 
500 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
485 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  45.92 
 
 
481 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  41.94 
 
 
463 aa  323  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  39.59 
 
 
469 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  37.47 
 
 
462 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  36.62 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38.22 
 
 
504 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
477 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  39.37 
 
 
466 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
476 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
474 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
478 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
474 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  37.33 
 
 
474 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
501 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
459 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
452 aa  253  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
463 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
459 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.1 
 
 
472 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.79 
 
 
472 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
463 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  37.61 
 
 
506 aa  243  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.79 
 
 
439 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  33.9 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
461 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
472 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
460 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  38.19 
 
 
467 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  38.52 
 
 
464 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  36.67 
 
 
460 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.33 
 
 
500 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
465 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  38.87 
 
 
442 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  38.75 
 
 
464 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  33.86 
 
 
460 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35 
 
 
474 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  37.59 
 
 
460 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  34.34 
 
 
483 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  36.08 
 
 
480 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  33.54 
 
 
494 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  33.54 
 
 
494 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  33.63 
 
 
460 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
460 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  34.34 
 
 
483 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
462 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  33.68 
 
 
495 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>