108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1672 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  69.23 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  69.23 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  69.39 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  70.03 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  62.89 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  60.98 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  60.47 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  60.07 
 
 		 304 aa  344  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  48.19 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  44.41 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  41.13 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  38.62 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  38.62 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  38.62 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  38.62 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  38.62 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  38.62 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  37.8 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  36.33 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.41 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  38.29 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  38.49 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  38.49 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  37.55 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  35.09 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  38.26 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  37.46 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  34.62 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  34.73 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  34.62 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.62 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  40.12 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  36.69 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  36 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.41 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  32.05 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.37 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.66 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  29.44 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.15 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.62 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.62 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  28.34 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  30.3 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  30.3 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  30.41 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  31.29 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  26.41 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  29.09 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  29.81 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  27.05 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  26.18 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  29.09 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  28.35 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  29.41 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  25 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  28.66 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  27.11 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  26 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  25.45 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  29.41 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  27.73 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  23.5 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  28.86 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  25.91 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>