225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0005 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  75.3 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  70.93 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  70.93 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  70.93 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  70.54 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  74.09 
 
 		 252 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  73.68 
 
 		 252 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  70.54 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  70.54 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  70.54 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  66.16 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  73.88 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  72.65 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  72.62 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  72.62 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  73.88 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  72.65 
 
 		 252 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  72.24 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  70.61 
 
 		 251 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  71.03 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  65.2 
 
 		 264 aa  349  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  65.32 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  59.85 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  59.04 
 
 		 259 aa  314  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  58.94 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.7 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  41.43 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  42.02 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.01 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.38 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40.73 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  40.48 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  44.09 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  44.09 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.6 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  41.83 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  39.2 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  43.65 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  41.41 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  44.02 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  40.55 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  41.44 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  41.47 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  42.13 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  41.27 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  38 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  43.58 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  42.25 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  41.73 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  45.57 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  41.96 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  42.13 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>