More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1258 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
398 aa  823    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  92.21 
 
 
398 aa  760    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  89.95 
 
 
398 aa  750    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  53.71 
 
 
402 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  53.39 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  53.91 
 
 
396 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  52.31 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  52.76 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  51.3 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  51.15 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  52.69 
 
 
400 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  52.55 
 
 
399 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  47.33 
 
 
396 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.22 
 
 
417 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.23 
 
 
397 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
399 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.27 
 
 
400 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.68 
 
 
399 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
395 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  47.14 
 
 
405 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
397 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
403 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.07 
 
 
395 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  48.95 
 
 
398 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.84 
 
 
396 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.47 
 
 
399 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.86 
 
 
427 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  49.21 
 
 
395 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.39 
 
 
396 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.46 
 
 
387 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  47.72 
 
 
418 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 
397 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
426 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  46.68 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  46.68 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.67 
 
 
385 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  48.14 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  48.14 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.41 
 
 
427 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  47.87 
 
 
394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  47.61 
 
 
394 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.92 
 
 
396 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
394 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
422 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  47.61 
 
 
394 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.35 
 
 
380 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  46.3 
 
 
390 aa  343  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.01 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  47.34 
 
 
394 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  47.34 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  46.54 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  46.54 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  45.01 
 
 
394 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  46.54 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  46.54 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  46.35 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.34 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 
394 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.97 
 
 
406 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.26 
 
 
406 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.92 
 
 
394 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  45.5 
 
 
395 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
388 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.16 
 
 
406 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.11 
 
 
401 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.16 
 
 
406 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 
510 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.93 
 
 
403 aa  329  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
436 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.78 
 
 
406 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.53 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
411 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.56 
 
 
416 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.33 
 
 
444 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.31 
 
 
406 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  43.31 
 
 
390 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
392 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.53 
 
 
385 aa  322  9.000000000000001e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  44.71 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  44.13 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.41 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.16 
 
 
413 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  43.39 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.88 
 
 
408 aa  319  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
398 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.35 
 
 
408 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  42.3 
 
 
388 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>