More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4261 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  99.55 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.44 
 
 
224 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  66.07 
 
 
225 aa  304  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.16 
 
 
225 aa  291  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.16 
 
 
225 aa  291  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 
224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 
226 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  59.01 
 
 
1629 aa  278  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  61.71 
 
 
684 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 
799 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 
652 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  60.99 
 
 
230 aa  249  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 
635 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 
635 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  54.71 
 
 
509 aa  241  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 
597 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 
614 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  56.5 
 
 
613 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  50.9 
 
 
725 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
222 aa  211  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
231 aa  204  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
225 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
224 aa  201  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
240 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
224 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 
224 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
283 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
224 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.37 
 
 
223 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
232 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
238 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
245 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 
225 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 
227 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
227 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
231 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 
222 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  42.42 
 
 
245 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44 
 
 
227 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 
231 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 
224 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.1 
 
 
237 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44 
 
 
236 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 
223 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 
231 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
227 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
220 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 
224 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
220 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 
224 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
235 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
222 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 
237 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 
224 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
220 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 
237 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
219 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 
237 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 
237 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 
224 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
224 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 
226 aa  181  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  42.04 
 
 
230 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 
220 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  43.54 
 
 
224 aa  181  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  43.84 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
230 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  41.89 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 
246 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 
227 aa  180  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
220 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 
250 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
237 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 
237 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  39.47 
 
 
237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.01 
 
 
218 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 
224 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
219 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
228 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
228 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
237 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>