More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1322 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  53.98 
 
 		 176 aa  201  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  50.88 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  51.18 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  53.07 
 
 		 250 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  49.73 
 
 		 266 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 201 aa  183  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  49.12 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  48.82 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.78 
 
 		 194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  51.12 
 
 		 266 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 		 273 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  48.02 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  48.54 
 
 		 174 aa  180  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  46.78 
 
 		 194 aa  180  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  48.24 
 
 		 188 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  49.41 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.82 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 306 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  48.82 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  47.42 
 
 		 276 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  47.12 
 
 		 271 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  47.12 
 
 		 270 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  47.12 
 
 		 270 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  48.11 
 
 		 280 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  47.85 
 
 		 265 aa  174  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  48.89 
 
 		 246 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  45.99 
 
 		 267 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 272 aa  173  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  45.03 
 
 		 317 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  47.43 
 
 		 243 aa  173  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 277 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  50 
 
 		 273 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  47.7 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  46.82 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  47.06 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  47.13 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  46.88 
 
 		 266 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  48.6 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  46.51 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  47.25 
 
 		 273 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  45.03 
 
 		 296 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.24 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  45.98 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 203 aa  167  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  46.2 
 
 		 175 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  45.66 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.95 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.53 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  45.55 
 
 		 299 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  45.35 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  45.35 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  47.7 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  45.98 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  45.98 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  44.77 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  47.7 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.78 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  47.13 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  45.98 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.78 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  45.71 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>