More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0005 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0004  DNA gyrase subunit B  48.36 
 
 
819 aa  690  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0307059 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0005  DNA gyrase subunit B  47.76 
 
 
814 aa  689  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5333  DNA gyrase, B subunit  47.18 
 
 
808 aa  659  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248882  normal  0.0644472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0003  DNA gyrase subunit B  45.8 
 
 
824 aa  649  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  47.69 
 
 
805 aa  681  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  3.87143e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  46.9 
 
 
814 aa  670  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  47.61 
 
 
806 aa  698  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  46.98 
 
 
804 aa  696  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  47.1 
 
 
804 aa  697  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 
804 aa  690  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  57.34 
 
 
635 aa  637  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  46.72 
 
 
830 aa  639  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  47.48 
 
 
806 aa  698  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  61.21 
 
 
633 aa  661  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  46.29 
 
 
815 aa  635  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0003  DNA gyrase, B subunit  45.5 
 
 
864 aa  638  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.65074e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0003  DNA gyrase subunit B  46.2 
 
 
824 aa  649  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.538686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  56.86 
 
 
644 aa  639  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0004  DNA gyrase subunit B  47.88 
 
 
813 aa  641  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  51.12 
 
 
802 aa  750  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  46.15 
 
 
812 aa  682  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  57.32 
 
 
640 aa  667  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  49.09 
 
 
814 aa  707  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0003  DNA gyrase subunit B  45.77 
 
 
842 aa  667  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0003  DNA gyrase subunit B  46.57 
 
 
823 aa  662  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0806649  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  47.1 
 
 
804 aa  696  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  48.71 
 
 
825 aa  727  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46448e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0003  DNA gyrase subunit B  45.84 
 
 
823 aa  644  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211892  hitchhiker  0.00365115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0819  DNA gyrase, B subunit  45.99 
 
 
817 aa  646  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.829459  normal  0.98352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0005  DNA gyrase subunit B  47.51 
 
 
814 aa  686  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0657  DNA gyrase, B subunit  45.81 
 
 
861 aa  642  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763999  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 
804 aa  690  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  46.63 
 
 
808 aa  677  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.24797e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0003  DNA gyrase subunit B  46.14 
 
 
824 aa  650  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326353  hitchhiker  0.000981669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  48.14 
 
 
795 aa  676  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  48.46 
 
 
807 aa  674  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  48.65 
 
 
805 aa  703  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  47.85 
 
 
806 aa  686  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.48 
 
 
807 aa  688  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  2.88479e-10 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  48.71 
 
 
811 aa  684  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  47.37 
 
 
806 aa  703  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  47.48 
 
 
826 aa  664  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  47.33 
 
 
810 aa  667  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  46.64 
 
 
812 aa  639  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.86 
 
 
812 aa  641  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  52.66 
 
 
794 aa  787  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  48.4 
 
 
805 aa  716  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  47.9 
 
 
806 aa  687  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  44.5 
 
 
769 aa  657  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 
804 aa  690  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  48.65 
 
 
805 aa  703  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  60.89 
 
 
648 aa  652  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3355  DNA gyrase subunit B  49.01 
 
 
805 aa  679  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.784759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  47.55 
 
 
814 aa  698  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  48.7 
 
 
813 aa  704  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  46.32 
 
 
804 aa  696  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.45 
 
 
813 aa  697  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  7.05515e-09 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  45.61 
 
 
769 aa  649  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  47.1 
 
 
804 aa  697  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  47.1 
 
 
804 aa  697  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  48.52 
 
 
805 aa  707  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  46.63 
 
 
810 aa  677  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  47.71 
 
 
814 aa  662  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27648e-15 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  44.21 
 
 
770 aa  639  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  49.01 
 
 
805 aa  709  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  46.98 
 
 
804 aa  699  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  59.54 
 
 
647 aa  675  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  58.5 
 
 
647 aa  661  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  58.46 
 
 
641 aa  637  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  56.88 
 
 
686 aa  665  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3095  DNA gyrase, B subunit  48.84 
 
 
803 aa  712  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0405  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  58.12 
 
 
645 aa  681  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  62.01 
 
 
648 aa  687  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  58.58 
 
 
654 aa  640  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  60.79 
 
 
661 aa  692  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  58.02 
 
 
657 aa  644  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  51.81 
 
 
796 aa  761  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0004  DNA gyrase subunit B  46.53 
 
 
805 aa  695  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.777143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0004  DNA gyrase subunit B  46.87 
 
 
803 aa  694  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03526  hypothetical protein  47.1 
 
 
804 aa  697  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  47.54 
 
 
803 aa  701  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  60.38 
 
 
648 aa  669  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  60.25 
 
 
637 aa  640  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  60.33 
 
 
656 aa  660  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  47.75 
 
 
810 aa  695  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
808 aa  1647  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.53 
 
 
647 aa  670  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.33 
 
 
640 aa  635  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  59.03 
 
 
636 aa  648  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0005  DNA gyrase, B subunit  44.78 
 
 
770 aa  640  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.19711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  61.35 
 
 
649 aa  655  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  54.93 
 
 
649 aa  671  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002006  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
805 aa  715  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.132236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0004  DNA gyrase, B subunit  48.3 
 
 
821 aa  686  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0004  DNA gyrase, B subunit  47.48 
 
 
817 aa  691  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0004  DNA gyrase subunit B  46.53 
 
 
805 aa  692  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  62.57 
 
 
640 aa  658  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0003  DNA gyrase subunit B  45.77 
 
 
842 aa  667  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267231  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4272  DNA gyrase subunit B  49.09 
 
 
811 aa  672  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  61.84 
 
 
640 aa  656  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>