More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2689 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 498 aa  1020    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.7 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.27 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 498 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.91 
 
 		 493 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.22 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.58 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 482 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 482 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 482 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 482 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 480 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.58 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  32.01 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.39 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.44 
 
 		 480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.13 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  32.01 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.03 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  32.3 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 399 aa  226  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.6 
 
 		 397 aa  225  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.06 
 
 		 399 aa  225  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  29.86 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  32.52 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  29.04 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  28 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 478 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 402 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 340 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  32.52 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  32.79 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 398 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 503 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  32.79 
 
 		 405 aa  216  9e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  31.35 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 397 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  32.25 
 
 		 395 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  32.88 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  31.98 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  31.98 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  31.79 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 393 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 393 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  31.71 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.52 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.73 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  31.17 
 
 		 398 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  34.7 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>