More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2162 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  47.9 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  43.51 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41.99 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  40.26 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  43.4 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  42.56 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.75 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  38.91 
 
 		 312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  39.67 
 
 		 241 aa  178  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.18 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  39.15 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.05 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  41.03 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  40.43 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.49 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  39.75 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  42.42 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  38.43 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.39 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.33 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  40.93 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  39.24 
 
 		 602 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  39.57 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  39.09 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  37.44 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.03 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.67 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  34.04 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.13 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  39 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  36.75 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  36.75 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  36.75 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.18 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  42.65 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  34.58 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  37.55 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  37.61 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  37.21 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.22 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  38.81 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.74 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  32.24 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  33.89 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  36.56 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  34.98 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.08 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  35.87 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  37.55 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  35.27 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  30.57 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  30.57 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.93 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  35.32 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  34.22 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  32.39 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.96 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.51 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  33.66 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  31.89 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  36.36 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  32.9 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  32.9 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  31.17 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  33.2 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  35.85 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  38.04 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  32.46 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  32.11 
 
 		 264 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  33.07 
 
 		 277 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  33.78 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  31.69 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  30.83 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  34.55 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  34.31 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  31.85 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  35.1 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  31.09 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.45 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.85 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  36.04 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  34.29 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  31.4 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.45 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.45 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  34.29 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  30.12 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  31.33 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.45 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  31.45 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  33.17 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  32.55 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  33.8 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  32.88 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  30.13 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  32.08 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.49 
 
 		 259 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  31.31 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>