More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0738 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  63.77 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  48.57 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  48.57 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  52.31 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  51.56 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  52.38 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  51.61 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  48.44 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.44 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  48.39 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  47.54 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  54.69 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  44.44 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  49.23 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  44.44 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 818 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  42.19 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  46.77 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 942 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  37.1 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  42.19 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  35 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  38.71 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.64 
 
 		 954 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  41.54 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  37.1 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  36.76 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  39.34 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  49.18 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 756 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 817 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 826 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  45.9 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 890 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  38.57 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  33.33 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  35.48 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  34.92 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  35.48 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  34.38 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 894 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 839 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 861 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 837 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>