More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0506 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  57.2 
 
 		 240 aa  305  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  52.28 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  53.94 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.94 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.94 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.94 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  53.53 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  50.83 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  50.83 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  50.83 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  50.42 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  53.53 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  52.56 
 
 		 245 aa  269  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.17 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  51.05 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.17 
 
 		 246 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.17 
 
 		 246 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.17 
 
 		 246 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  51.05 
 
 		 246 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.84 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  51.48 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.12 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.74 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.36 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.74 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  49.79 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.1 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.52 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.52 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.95 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2407  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.75 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2346  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  47.06 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.09 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.09 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.09 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  48.52 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1728  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  47.68 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  47.68 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.71 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  52.27 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  50.21 
 
 		 266 aa  238  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1999  pyruvate-formate lyase activating enzyme  48.75 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  45.11 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0217  pyruvate formate-lyase activating enzyme  51.03 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0211  pyruvate formate-lyase activating enzyme  51.03 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1398  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  51.04 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2365  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  48.96 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1147  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  44.73 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45.87 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45.87 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  44.59 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  46.86 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45.53 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0038  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.61 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.6 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2981  pyruvate formate-lyase activating  43.04 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.743712  normal  0.290746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.48 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1081  pyruvate formate-lyase activating  42.62 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  38.03 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  39.51 
 
 		 334 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2097  radical SAM family protein  43.16 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  43.44 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  37.17 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.41 
 
 		 293 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  41.15 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0890  pyruvate formate-lyase activating  39.38 
 
 		 275 aa  187  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.999298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3207  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.43 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000377553  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1397  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.559642 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36094  predicted protein  35.43 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.1 
 
 		 298 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  31.98 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.58 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.13 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.58 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.56 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  38.79 
 
 		 322 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  31.06 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.5 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  29.17 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>